康熙称不让宝日龙梅留在身边是不想为任何人利用，但他一定会剿灭葛尔丹，并恩施宝日龙梅留在苏麻喇姑身边。胤禔万分沮丧。蓝齐儿送李光地赴闽就任，又与葛尔丹相遇。葛尔丹把在京城所购丝绸等物全部烧毁，发誓重建元大都。胤礽在索府喜欢上了收留的孤女红玉。朝政之上，胤礽提出立即收复台湾，群臣附议。康熙封索额图为钦差大臣，前往福建督战。索额图来到福建，姚启圣、施琅、李光地均表示反对立即攻台，认为目前各方面条件并不成熟，但索额图力主战事，并以康熙相压，姚启圣对索额图称，明日一早相报最后决定。姚启圣仔细分析索额图意图，决定给康熙上折。

　　水师全军挫败，但施琅得胜归来。康熙下旨索额图回京。姚启圣上奏请罚，康熙准其回家丁忧。姚启圣离职之前，给康熙上了一折，称攻台之前曾给康熙上过三折，康熙并未收到，大为震怒，下旨彻底清查，兵部经办官员引咎自尽，保护了幕后主子。慧妃向康熙称赞胤禔。康熙病中召胤禔来见，胤禔称兵部压制姚启圣三封奏折，乃是有意而为，目的是为了保护索额图，并说上次胤礽在朝政上率先提出力主攻台，也是索额图的意思。

　　明珠与郑经使者冯西范讨价还价，初步达成招抚条件，但最后冯西范提出郑经要三年以后才能登岸，得寸进尺，康熙下旨向郑经开战。姚启圣重被启用。姚启圣、施琅、李光地三人联名向康熙立下收台军令状。郑经巡视海防，进行部署安排。旗兵为了军备，又抢民财，与汉兵水师发生纠纷。姚启圣上奏康熙要求旗兵离闽，葛尔丹又兵犯蒙古各族，军力大增。康熙请明珠和索额图主持庭仪，康熙病恙回去休息。

　　蓝齐儿向孝庄皇太后哭诉，孝庄讲诉自己经历，称女人为了大清国必须做出牺牲。蓝齐儿说父皇一定会在今后消灭葛尔丹，她该如何对待。孝庄称女儿唯独不能有自己。姚启圣与施琅在具体攻台策略上发生矛盾，双方上折康熙，康熙下旨命施琅专权主持平台事务，姚启圣免职回家继续丁忧。康熙下旨给魏东亭，近日将出巡南京，就近督促平台战事，并核实三千万两饷银是否筹齐。魏东亭喜中有忧。江苏道台葛礼怀疑南京栖霞寺的应空和尚就是杨起隆，向他敲诈八百万两银子，杨起隆无奈只好同意。

　　康熙出巡南京，途中接到福建来报，请求攻台时间推迟一日，康熙下旨必须按原定日期收台。姚启圣称这是康熙为了重阳节那一天在明孝陵宣布平台，以便收服大明遗民之心。施琅出师攻台，群情振奋，姚启圣也要上船助战，施琅不允，说他不懂海事。姚启圣称他为了收台，祖坟都让人家挖了。施琅叫姚启圣拿出康熙密旨。姚启圣上船以后，施琅起锚出击。康熙在南京受到出击报告，甚为喜悦。康熙问魏东亭军饷筹备情况，魏东亭说尚不足，拟将家资也充入，康熙给他出了不少筹饷主意。魏东亭下令严搜紫金山和栖霞山，寻找三门大炮。葛礼向杨起隆索要八百万两银子。

　　葛礼亲自率兵到栖霞寺找寻银两，三门大炮也找到，魏东亭称也将栖霞寺银两作军饷，但杨起隆逃掉了。康熙因魏东亭渎职进行处罚，给他两条出路，魏东亭选择了去台澎当知县。康熙恩赏姚启圣、施琅、李光地三人，并对李光地期望很大。葛尔丹接走蓝齐儿，蓝齐儿向胤禔反射一箭，称她已是葛尔丹的女人。葛尔丹继续扩张，并暗中得到沙俄支持，严重威胁大清皇权。葛尔丹东迁，逼近内地。葛尔丹和蓝齐儿有了孩子以后，恩爱和睦，葛尔丹专门为蓝齐儿建造了一座仿照北京的宫廷让她居住。蓝齐儿问葛尔丹东迁是否是为了攻打北京，葛尔丹明白无误称是。